Перебрал немало вариантов, вот последний из них.
<{CODE_COLLAPSE_OFF}><{CODE_WRAP_OFF}>
<CustomAction Id='RegExeX86' FileKey='ExeX86.exe' ExeCommand='/regserver' Return='check' Execute='commit' Impersonate='no'/>
<CustomAction Id='RegExe' FileKey='Exe.exe' ExeCommand='/regserver' Return='check' Execute='commit' Impersonate='no'/>
<CustomAction Id='UnregExeX86' FileKey='ExeX86.exe' ExeCommand='/unregserver' Return='check'/>
<CustomAction Id='UnregExe' FileKey='Exe.exe' ExeCommand='/unregserver' Return='check'/>
<InstallExecuteSequence>
<RemoveExistingProducts After='InstallInitialize' />
<Custom Action='RegExeX86' After='PublishProduct'>
<![CDATA[$ExeX86.exe>2 AND UILevel>3]]>
</Custom>
<Custom Action='RegExe' After='RegExeX86'>
<![CDATA[$Exe.exe>2 AND UILevel>3]]>
</Custom>
<Custom Action='UnregExeX86' After='InstallInitialize'>
<![CDATA[REMOVE="ALL"]]>
</Custom>
<Custom Action='UnregExe' After='UnregExeX86'>
<![CDATA[REMOVE="ALL"]]>
</Custom>
</InstallExecuteSequence>
В результате установка и регистрация проходит вроде нормально, а вот при удалении ошибка и откат. Подозреваю, что в момент попытки разрегистрации файлов уже нету, или что-то в таком духе. Пробовал вместо After='InstallInitialize' - Before='RemoveFiles', но результат был такой же...
